Widzę dwa rozwiązania:
1. wybierasz się do jakiegoś serwisu, który może ściągnąć fabryczną konfigurację "as build" na podstawie VIN i załadowac do BCMa
2. metodą prób i błędów modyfikujesz konfigurację w BCM, w nadziei że w końcu znajdziesz parametr które powoduje błąd.
Osobiście sugeruję wariant 1 - bezpieczniej i szybciej.
Wariant 2 jest oczywiście znacznie ciekawszy poznawczo, ale kryje w sobie ryzyko, że tak namieszasz w konfiguracji, że skończy się wizyta w serwisie (szczególnie trzeba uważać z ustawieniami rodzaju zapłonu, żeby nie zmienić z kluczyka na guzik i odwrotnie). Jeżeli chcesz próbować, to:
a) ściągnij i zachowaj aktualną (z wyskakującym błędem) konfigurację z BCM
b) ustaw kilka pozycji na "Without..." albo "Not configured..." (pamiętając żeby nie zmieniać ustawień w "Keyless entry and strat") i zapisujesz do BCMa.
c) sprawdzasz czy nadal jest błąd - jeżeli tak to p. b), jeżeli jest ok to d)
d) otwierasz konfig z p. a), zmieniasz w nim parametr(y) który ustaliłeś jako powodujący błąd i ładujesz do BCM
Możesz też spróbować ściągnąć konfigurację fabryczną z
https://www.motorcraftservice.com/AsBuilt i ją załadować
https://forscan.org/forum/viewtopic.php?t=1932
albo analizować ją ręcznie podpierając się
https://forscan.org/forum/viewtopic.php?t=4393
Na koniec drobna uwaga - skoro problem z baterią spowodował przekłamania w pamięci BCMa to może oznaczać usterkę w samym module, zatem tego rodzaju problemy mogą sie pojawiać w przyszłości.